Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa3P28310 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa3P28310 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms