Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gjb1P28230 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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