Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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