Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd8P23463 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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