Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkcaP20444 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms