Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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