Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pou4f1P17208 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pou4f1P17208 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pou4f1P17208 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms