Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sptan1P16546 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptan1P16546 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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