Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FosbP13346 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FosbP13346 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FosbP13346 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FosbP13346 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FosbP13346 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FosbP13346 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FosbP13346 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FosbP13346 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FosbP13346 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms