Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ApcsP12246 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ApcsP12246 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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