Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sub1P11031 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms