Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxb4P10284 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms