Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Myod1P10085 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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