Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm3P0DP28 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms