Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Psmg4P0C7N9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms