Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TtrP07309 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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TtrP07309 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TtrP07309 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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