Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfrbP05622 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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