Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01853 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01853 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01853 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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