Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lnx1O70263 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lnx1O70263 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms