Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Ldb2O55203 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb2O55203 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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