Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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