Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lhx8O35652 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms