Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms