Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Prrt1O35449 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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