Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pitx3O35160 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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