Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Eftud2O08810 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms