Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PrkcshO08795 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkcshO08795 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms