Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sema3aO08665 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms