Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2056J3QQ02 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms