Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm8356J3QPD3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8356J3QPD3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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