Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20828J3KMI7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms