Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AK157302I3ITR1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms