Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms