Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod3E9QA62 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms