Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd35E9Q9D8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms