Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20518E9Q548 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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