Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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