Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brd1E9PZ26 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd1E9PZ26 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms