Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200bD3Z0P8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms