Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Tgfbr3lD3YZZ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms