Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd1D3YXK1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms