Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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