Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Plekhd1B2RPU2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Plekhd1B2RPU2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms