Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms