Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Trabd2bB1ATG9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trabd2bB1ATG9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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