Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rtf1A2AQ19 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rtf1A2AQ19 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms