Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms