Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip6Q9Z1Y4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip6Q9Z1Y4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms