Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn13Q9Z0S4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn13Q9Z0S4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn13Q9Z0S4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms