Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nphp1Q9QY53 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms